课程主页: https://www.coursera.org/learn/assembling-genomes
课程简介
在2011年春季，德国发生了一场致命的疾病疫情，数千人因食物中毒和出现带血腹泻而住院，最终导致肾衰竭。这次疫情由一种神秘的细菌株——E. coli X引起，成为近年来最致命的疫情之一。这门《基因组组装编程挑战》课程让我们跟随生物信息学家的脚步，学习如何组装这个致命细菌的基因组，特别适合对生物信息学和编程感兴趣的学生和专业人士。
课程大纲
2011年欧洲E. coli疫情
课程首先回顾了2011年德国疫情的背景，详细讲解了为遏制疫情蔓延而进行的基因组序列分析任务。通过理解E. coli X如何演变成致病菌，学员能够更好地认识生物信息学在公共健康中的应用。
使用de Bruijn图组装基因组
课程接下来探讨了de Bruijn图在DNA测序中的应用，特别是如何使用这些信息来降低测序成本和改进组装方法。通过学习历史背景，包括18世纪的柯尼斯堡桥问题，学员将提高解决复杂算法问题的能力。
现实测序数据的基因组组装挑战
课程的最后部分聚焦于现代测序技术带来的实际挑战，介绍了相应的算法技术。学员将尝试组装生活在叶虫中的最小细菌基因组，为最终组装E. coli X基因组做准备。
总结与推荐
经过对这门课程的深入学习，可以发现它不仅仅是编程和算法的训练，更是对生物学与数据科学交叉领域的开拓。特别是对于那些希望在生物信息学领域找到职业发展的学习者，这门课程提供了非常有价值的实践经验和知识储备。推荐给所有对生物科学和计算技术有兴趣的朋友们，这将是一次值得投资的学习体验！
课程主页: https://www.coursera.org/learn/assembling-genomes