课程主页: https://www.coursera.org/learn/dna-sequencing
课程概述
《DNA测序算法》是一门极富挑战性和实践性的在线课程,旨在帮助学习者深入了解DNA测序数据的计算方法,即算法和数据结构。课程不仅介绍了一些DNA和基因组学的基础知识,还探讨了DNA测序的实际应用。通过使用Python,学习者将能够实现关键的算法和数据结构,并分析真实的基因组和DNA测序数据集。
课程大纲
第一模块:DNA测序、字符串与匹配
在这一模块中,我们将开始探索分析DNA测序数据的算法。首先,我们会讨论DNA测序技术的历史及其现状,以及其工作原理。
第二模块:预处理、索引与近似匹配
在这一模块中,我们学习解决精确匹配和近似匹配问题的有效和灵活的新算法。我们将从学习Boyer-Moore算法开始,这是一个广泛使用的精确匹配快速算法。
第三模块:编辑距离、拼接与重叠
这一周将结束我们对读取比对讨论,学习解决编辑距离问题和生物序列分析相关问题的算法,如全局和局部比对。
第四模块:拼接算法
在最后的模块中,我们开始讨论拼接问题,并学习解决比对问题的一些基本原则和方法。
课程评测
整体来看,这门课程内容丰富、实践性强,适合对生物信息学和计算生物学感兴趣的学习者。课程中的算法实现部分使用Python,使得学习变得更加直观和易于掌握。特别是涉及到实际DNA数据集的分析,能够让学员在实践中提高自身的技能。此外,讲师对各个模块的讲解深入浅出,能够激发学习者的兴趣并帮助其高效吸收知识。
总的来说,《DNA测序算法》课程不仅适合编程基础良好的学员,也欢迎对基因组学感兴趣的初学者。无论你是生物学学生,还是想转型到生物信息学领域的专业人士,这门课程都将极大地拓宽你的视野,提升你的竞争力。
课程主页: https://www.coursera.org/learn/dna-sequencing