课程主页: https://www.coursera.org/learn/bd2k-lincs
随着大数据时代的到来,掌握大数据科学的知识变得越来越必要。今天,我想向大家推荐一门在Coursera上开设的课程——《大数据科学与BD2K-LINCS数据协调与整合中心》。这门课程由美国国家卫生研究院(NIH)支持的LINCS项目为基础,提供了丰富的理论知识和实践技能。
课程概述:LINCS项目持续了十年,旨在研究通过不同的方式干扰人类细胞,包括药物、基因操作和外部环境条件等。从中可以找到细胞对不同刺激的反应,进而对生物医学研究有着深远的影响。
课程包括以下模块:
- LINCS项目概述:介绍LINCS项目的概念,并提供使用LINCS L1000数据集的入门教程。
- 元数据和本体:高层次描述元数据和本体的概念及其在LINCS数据集中的应用。
- 通过API提供数据:讲解如何通过应用程序接口(API)访问数据的概念。
- 生物信息学管道:描述生物信息学管道的重要概念。
- Harmonizome项目:整合多个基因与蛋白质知识资源的项目,提供一个在线应用平台。
- 数据归一化和聚类:讲解数据归一化和无监督学习的数据聚类概念。
- 中期考试:涵盖前七个模块的45道选择题考试,部分题目涉及新数据集的分析。
- 富集分析:介绍基因集富集分析的重要性。
- 机器学习:阐述有监督机器学习的数学概念。
- 基准测试:讨论如何比较和评估生物信息学管道。
- 互动数据可视化:提供创建互动网页数据可视化元素的编程示例。
- 众包项目:描述超出课程的LINCS相关项目工作机会。
- 期末考试:涵盖所有模块的60道选择题考试,部分题目关于新数据集的分析。
这门课程不仅适合有生物科学背景的学生,也欢迎数据科学爱好者加入学习。在课程中,我们将进行大量的实践操作,使学习变得更加深入和有趣。
如果你对大数据和生物信息学有兴趣,这门课程绝对值得推荐!通过学习,你将掌握现代生物医学研究的热门工具和方法,更好地理解数据在生物科学研究中的重要性。
课程主页: https://www.coursera.org/learn/bd2k-lincs