课程主页: https://www.coursera.org/learn/plant-bioinformatics-capstone
课程概述
Plant Bioinformatics Capstone 是一门由 Coursera 提供的高水平课程，主要针对植物生物学的研究人员与爱好者。过去的15年中，植物生物学经历了激动人心的发展，数百个植物基因组已被测序，RNA-seq 使得转录组的表达分析能够展开。各种基于’-seq’的方法使得蛋白质-蛋白质和蛋白质-DNA的相互作用能够以低成本、高通量的方式被确定。这些数据集使我们能够通过简单的点击或轻触来生成假设。
课程内容详情
本课程涵盖了关于如何在在线数据库中探索我们感兴趣的基因的信息，包括：
第一周：探索目标基因
我们将以阿拉伯芥中一个大部分未知功能的目标基因 At3g20300 为例，探讨在线数据库所能提供的有关该基因的信息。我们将对该基因的大小、同源基因、系统发育关系、结构域信息以及亚细胞定位等内容进行调查。
第二周：识别相关基因
通过与目标基因共同表达的基因，我们通常能够获取一些关于目标基因功能的线索。我们将探索与 At3g20300 共同表达的基因，并寻找共同的调控基序。
第三周：分析目标基因功能及其网络
我们将进行基因本体富集分析，分析共同表达基因的作用，并探讨我们目标基因可能的功能角色。
第四周：撰写实验报告
我们会将以上分析合成信息，撰写一份实验报告草稿，描述关于我们目标基因的可能功能，并提议相应的实验以验证我们的假设。
最终报告
根据同行评审的反馈，完善草稿，并提交最终报告，报告将包括图示，通常需要在13-15页之间。
总结与推荐
该课程不仅系统性地教授了植物生物信息学的基础知识，还促进了实践能力的提升。通过理论与实践相结合，学员可以获得宝贵的研究技巧。对于希望深入了解植物基因组及其功能的研究人员，这门课程无疑是一个极好的选择。
课程主页: https://www.coursera.org/learn/plant-bioinformatics-capstone