课程主页: https://www.coursera.org/learn/bioinformatics-methods-2
在当今生物科学中,大规模生物学项目如人类基因组测序和RNA-seq、微阵列等技术的应用,产生了大量的数据。这些数据对于生物学家而言是一把双刃剑:如何有效地分析和访问这些数据,从中提取有用的信息,是科学家们面临的一大挑战。Coursera上的《生物信息学方法 II》课程正是为了解决这一需求而设立的。
本课程主要利用现有的生物信息学资源,包括基于网络的程序和数据库,来访问和分析丰厚的数据,以回答研究中所提出的问题。课程内容丰富,旨在提升学习者对于生物信息数据的处理能力,以及对生物过程的理解。
### 课程大纲
1. **蛋白质基序** – 探索蛋白质家族中的保守区域。这些区域对我们理解序列的生物学特性至关重要,有助于功能的推测。
2. **蛋白质-蛋白质相互作用** – 讨论蛋白质间的相互作用及其检测方法,并使用不同工具来分析BRCA2蛋白的交互伙伴。
3. **蛋白质结构** – 研究蛋白质三维结构的重要性,使用PDB数据库探索结构相似性,并利用PyMOL软件进行深入分析。
4. **基因表达分析 I & II** – 学习基因表达的时空特异性,使用RNA-seq数据进行处理和分析,利用BioConductor进行可视化和差异表达基因的识别。
5. **顺式调控系统** – 研究基因调控的短序列,探索与特定基因共同表达的启动子中的调控元素。
6. **课程总结与最终作业** – 通过回顾前述内容,巩固知识,并完成一项综合性的项目。
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这门课程特别适合那些有一定生物学和计算机基础的人士,尤其是希望深入理解生物数据分析及其在生物学研究中应用的科研人员。通过实际操作和理论学习的结合,学员不仅能够掌握分析技巧,还能加深对生物过程的理解。
此外,课程中的实践环节,如使用PyMOL和BioConductor进行数据分析,不仅增强了学习的趣味性,也提高了实际操作能力。总的来说,如果你对生物信息学感兴趣并希望提升自己在数据分析方面的能力,《生物信息学方法 II》绝对是一个值得报名的优质课程!
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