课程主页: https://www.coursera.org/learn/dna-sequencing
在这门名为《DNA测序算法》的Coursera课程中,学员将深入学习用于分析DNA测序数据的计算方法,包括算法和数据结构。课程内容涵盖DNA及基因组的基础知识,以及DNA测序的应用。通过使用Python,学员将实现关键算法和数据结构,分析真实的基因组和DNA测序数据集。
课程大纲分为多个部分,首先介绍了DNA测序、字符串和匹配。在这一模块中,学员将开始探索用于分析DNA测序数据的算法,讨论DNA测序技术的历史和现状。
接下来,课程会讲述数据预处理、索引和近似匹配,学习一些用于解决确切和近似匹配问题的新算法,例如Boyer-Moore算法,这是一种快速且广泛使用的确切匹配算法。之后,课程进入编辑距离、拼接和重叠的讨论,学习解决编辑距离问题和相关生物序列分析问题的算法,如全局对齐和局部对齐。
最后,课程将介绍与拼接相关的算法,并讨论解决对齐问题的一些基本原则。通过这一系列模块的学习,学员不仅可以掌握DNA测序的理论知识,还可以动手实践,运用Python编程技巧,实现和分析算法。这门课程无疑为希望在生物信息学和数据分析领域发展的学员提供了坚实的基础,是一门值得推荐的学习资源。
课程主页: https://www.coursera.org/learn/dna-sequencing