课程主页: https://www.coursera.org/learn/assembling-genomes
在2011年春天，德国爆发了一场致命的疾病，成千上万的人因食物中毒而住院，病症以血性腹泻为主，往往导致肾衰竭。这场疫情是最近历史上最致命的疫情之一，原因是一个神秘的细菌毒株，我们称之为E. coli X。德国官员很快将疫情与吕贝克的一家餐厅联系在一起，几乎20%的顾客在一周内都出现了血性腹泻。生物学家们需要弄清E. coli X的基因组序列，以找出其获取病原性的新基因，从而阻止疫情的进一步传播。
本课程《基因组组装编程挑战》追溯了生物信息学家们在疫情调查中的工作，启发学生们开发多个程序以组装致命菌株E. coli X的基因组。在学习之前，课程首先会介绍一些基因组概念，帮助学生通过解决一个较简单的病毒组装问题来热身。
课程的一个核心模块是利用de Bruijn图组装基因组。学员将深入了解DNA序列测定的演变过程，以及由此产生的个人化医学的影响。此外，课程还将讨论现代测序技术中引入的实际挑战，探讨一些算法技术来解决这些挑战，最终学员将有机会组装生活在叶蝉体内的最小细菌基因组，以此为准备进行E. coli X基因组的组装。
该课程不仅提供了一个富有挑战性的学习体验，还让学员在生物信息学和计算生物学的前沿进行探索。通过理论与实践相结合的方式，学生将获得在真实测序数据中处理基因组组装问题的宝贵能力，极大地拓展了他们的技术视野。对于有意在生物技术、医药科学或计算生物学领域深造的学生而言，这门课程无疑是一次难得的机会。
课程主页: https://www.coursera.org/learn/assembling-genomes