课程主页: https://www.coursera.org/learn/plant-bioinformatics
近十五年来，植物生物学经历了令人兴奋的发展阶段。随着数百种植物基因组的测序，RNA-seq的出现使我们能对转录组进行广泛的表达分析，并出现了许多基于’-seq’的方法，使蛋白质-蛋白质和蛋白质-DNA相互作用能够以低成本和高通量的方式被确定。这些数据集使我们可以轻松生成假设，从而推动植物生物学的研究。
在Coursera上，我发现了一门名为《植物生物信息学》的课程，这门课程对任何对植物科学和生物信息学感兴趣的人都是一个极好的选择。
课程内容覆盖了多个重要领域，包括:
- 植物基因组数据库：本模块探索了多个植物数据库，如Ensembl Plants、Gramene和TAIR等，帮助学员理解如何快速查询基因功能及其在物种间的同源性。
- 表达分析：通过使用RNA-seq数据和多种可视化工具，学习分析基因的表达模式及其与表型的关系。
- 共表达工具：使用WGCNA等算法，将基因按表达模式进行分类，为后续的假设生成打下基础。
- 启动子分析：探索转录因子如何通过结合启动子上的cis元件来调控基因表达。
- 功能分类和通路可视化：使用Gene Ontology富集分析等工具，分析差异表达的基因，探讨生物过程或分子功能的相关性。
- 网络探索：了解蛋白质之间的相互作用网络，揭示分子如何在细胞中协同工作，从而影响植物生物学的多个方面。
通过课程的学习，我不仅提高了对植物生物信息学的理解，还掌握了使用多个生物信息学工具的技能。这些工具可以直接应用于研究工作，非常实用。如果你对植物科学的实际应用有兴趣，这门课程无疑会为你打开新的大门。
总之，《植物生物信息学》是一门非常值得推荐的课程，无论你是学生还是专业研究人员，都能够从中受益良多。快去Coursera上看看吧！
课程主页: https://www.coursera.org/learn/plant-bioinformatics