课程主页: https://www.coursera.org/learn/plant-bioinformatics-capstone
植物生物信息学领域在过去15年经历了快速发展，许多植物基因组被测序，RNA-seq促进了全转录组的表达谱分析，基于‘-seq’的方法使得蛋白质-蛋白质和蛋白质-DNA的相互作用能够以低成本和高通量的方式被确定。这些数据集使我们能够轻松生成假设。在Coursera上提供的《植物生物信息学顶点课程》中，我们将学习33个植物特有的生物信息学工具和技术。
课程的第一周，我们将通过示例基因（大多数未知功能的阿拉伯芥基因At3g20300）来探索在线数据库。课程的第一部分将使用我们在植物生物信息学中探讨的工具来收集该基因的相关信息，如基因大小、同源基因、与其他序列的系统发育关系、结构域信息和亚细胞定位等。第二部分探索基因表达数据库，以了解该基因的表达位置，因为基因的表达时间和位置常常能提供关于其功能的线索。
在后续模块中，我们将识别与我们的目标基因相关的基因关系，残留基因的共同表达能够给我们关于目标基因功能的提示。同时，我们还将进行基因本体富集分析，以推测目标基因及其网络中其他基因的功能。最后，课程将指导我们撰写实验报告，通过同伴评审获得反馈并进行最终报告的润色。
总体来说，这门课程非常适合对植物生物学感兴趣的研究者，提供了实用的技能和知识，帮助学习者在生物信息学领域中进行深入探索和研究。通过结合理论与实践，参与者不仅能掌握工具，还能有效分析数据、提出实验假设，是提升学术能力的一个绝佳选择。
课程主页: https://www.coursera.org/learn/plant-bioinformatics-capstone