课程主页: https://www.coursera.org/learn/informatics
课程概述
随着基因组学的迅速发展,细菌生物信息学在科研和医疗领域变得越来越重要。本课程‘Bacterial Bioinformatics’专为希望掌握细菌序列数据分析的学生和研究人员设计,提供了一系列实用的演示和练习。这门课依托于BV-BRC(细菌和病毒生物信息学资源中心),是一个整合了多种资源的平台,使得研究者能够更好地分析细菌基因组数据。
课程大纲
课程包括以下几个关键模块:
- 介绍:学习BV-BRC的基本功能和特点,熟悉其提供的数据和分析工具。
- 组装:通过BV-BRC基因组组装服务,掌握从细菌序列读取中组装基因组的步骤。
- 注释:熟悉如何使用BV-BRC的细菌基因组注释服务,对基因组进行有效的注释。
- 综合基因组分析:进行全面的基因组分析,包括组装、注释及自动化分析。
- 基于密码子的系统发育树:利用BV-BRC系统生成基于密码子的系统发育树,掌握相关操作。
- 相似基因组查找器:学习如何使用该工具查找与自己的基因组相似的基因组。
- 蛋白质家族分类器:比较不同基因组中蛋白质家族的存在情况和计数。
- 蛋白质组比较:掌握如何比较不同基因组的蛋白质组与参考基因组。
课程推荐
这门课程非常适合所有希望深入了解细菌生物信息学的学生与研究人员。无论是初学者还是有经验的科研工作者,这里的内容都能提供实用的理论和技能。
特别是对于那些涉及微生物研究、基因组学及相关领域的专业人士来说,此课程无疑能够让您在生物信息学的旅程中走得更远。
总结
总之,《Bacterial Bioinformatics》课程通过实操演练,结合BV-BRC平台的强大功能,能够帮助学习者在细菌基因组分析方面建立坚实的基础。强烈推荐!
课程主页: https://www.coursera.org/learn/informatics