课程主页: https://www.coursera.org/learn/bioinformatics-methods-1
课程概述
随着人类基因组测序和RNA-seq、微阵列等技术的大规模生物学项目的推进,生物学家们获得了海量的数据。然而,科学家们面临的挑战是如何分析并访问这些数据,从中提取有关研究系统的有用信息。本课程专注于使用现有的生物信息学资源,主要是基于网络的程序和数据库,来获取这些丰富的数据,以回答科学研究中的各种问题。
课程大纲
1. NCBI/Blast I: 探索美国国立卫生研究院的生物技术信息中心(NCBI),进行Blast搜索以寻找相似序列,推测基因或蛋白质的功能。
2. Blast II/比较基因组学: 继续利用NCBI资源,执行多种Blast搜索。我们将比较不同物种的基因组部分,了解它们的相似性。
3. 多序列比对: 使用Clustal、MUSCLE和MAFFT进行多序列比对,揭示序列中的保守区和变异区,帮助理解生物学背景。
4. 系统发育学: 基于上一步生成的多序列比对进行系统发育分析,推测序列的演化关系及历史事件。
5. 选择分析: 使用DataMonkey分析一组细菌的同源序列,识别在正选择、负选择或中性选择下的重要位点。
6. ‘下一代’序列分析(RNA-Seq) / 生态基因组学: 探索新一代测序技术生成的数据,了解基因的表达与替代剪接。
学习收获
本课程不仅为我们提供了生物信息学的基本理论知识,更是通过实际案例,加深了对生物数据分析的理解。它使我能够熟练使用各种生物信息工具,提高了我的数据分析能力。
推荐理由
如果你对现代生物学研究有兴趣,尤其是数据分析和基因组学,那么《生物信息学方法 I》绝对是一个值得推荐的课程。通过这一学习经历,你将能够更好地利用生物数据,参与到前沿研究中。
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