课程主页: https://www.coursera.org/learn/bioinformatics-methods-1
在当今生物学研究中，海量的数据与日俱增，特别是人类基因组测序和RNA-seq等技术的发展使生物学家面临新的挑战。课程《生物信息学方法 I》提供了一个绝佳的机会，让学习者了解如何利用现有的生物信息学资源，尤其是网页程序和数据库，来分析海量的数据并提取有价值的信息。
### 课程概述
本课程为期几周，涵盖了多个重要的生物信息学主题，从NCBI/Blast的基本资源到复杂的序列比对与系统发育分析，为学员提供了系统化的学习体验。课程内容包括但不限于：
1. **NCBI/Blast I**：学习如何利用NCBI平台进行Blast搜索，从庞大的NR序列数据库中查找相似序列，推导同源性。
2. **Blast II/比较基因组学**：继续深入NCBI，使用多种Blast搜索，比较不同物种的基因组。
3. **多序列比对**：利用Clustal、MUSCLE、MAFFT等软件进行多序列比对，揭示序列中的保守与变异区域。
4. **系统发育学**：利用多序列比对数据进行系统发育分析，构建序列之间的进化关系树。
5. **选择分析**：分析正、负和中性选择下的正交序列，加深对蛋白质编码序列生物功能的理解。
6. **‘下一代’序列分析（RNA-Seq）/宏基因组学**：探索由于测序成本减低而生成的数据，分析基因表达及其替代剪接情况。
### 课程评价
整体来看，《生物信息学方法 I》是一门结构合理、内容丰富的课程，适合有意深入生物信息学的学员。章节之间的逻辑衔接与实践操作相结合，使学员不仅仅停留在理论层面，而是在实践中掌握生物信息学的核心工具和技巧。此外，课程提供的实例分析和数据集，使学员能够在实际应用中增强学习效果。
推荐给对生物数据分析感兴趣的科学家、研究生和大学生，这门课程将为他们在生物学领域的研究提供强大的技术支持与指导。
课程主页: https://www.coursera.org/learn/bioinformatics-methods-1