课程主页: https://www.coursera.org/learn/bioinformatics-methods-2
《Bioinformatic Methods II》是一门重要的在线课程，旨在帮助学生掌握大量生物信息学数据分析的技能。随着人类基因组测序和RNA-seq、微阵列等技术的发展，生物学家们积累了大量的数据。然而，如何有效地分析和访问这些数据，以提取与研究系统相关的有用信息，成为科学家面临的一大挑战。本课程侧重于使用现有的生物信息学资源，主要是基于网页的程序和数据库，来获取这些数据。
课程的第一部分涵盖了蛋白质动机（Protein Motifs），学生将学习如何探索蛋白质家族中保守的区域，这些区域与生物学功能相关。接下来，蛋白质-蛋白质相互作用（Protein-Protein Interactions）的模块将探讨蛋白质之间的重要联系，以及使用不同方法来确定这些相互作用的优势与劣势。在结构部分，课程讲解了如何确定蛋白质的三级结构，并使用PyMOL等软件深入探索多个蛋白质结构。
课程的后半部分专注于基因表达分析（Gene Expression Analysis）。学生将学习如何处理和分析RNA-seq生成的基因表达数据，并使用BioConductor对数据进行可视化。此外，也会探讨cis调控系统的概念，了解转录因子和调控蛋白如何影响基因表达模式。
通过综合这些内容，《Bioinformatic Methods II》提供了一个全面的视角，使学生能够更好地理解和应用生物信息学工具与技术。无论是生物学研究人员还是数据分析人员，此课程都将为他们提供宝贵的知识和实际技能，以应对现代生物学中数据分析的挑战。
课程主页: https://www.coursera.org/learn/bioinformatics-methods-2